台灣幾乎各地都有溫泉，十九個溫泉發展協會、促進會遍布全台，泡湯時常聽到業者介紹自己的泉質是碳酸泉、碳酸氫鈉泉、鐵泉、硫磺泉、氯化物泉等，不過這些溫泉到底有什麼區別，中華民國溫泉觀光協會理事長張榮南表示，台灣溫泉的命名與泉質，是用溫泉水中對人體有益處的微量元素來區分。
根據經濟部中央地質調查所研究，溫泉可依成份中含量佔最多數的陰離子做為分類依據，溫泉水中最常見的陰離子有氯離子（Cl-）、碳酸氫根離子（HCO3-）和硫酸根（SO42-）三種。當陰離子成份以氯離子為主時便歸類為氯化物泉，以碳酸氫根離子為主時為碳酸氫鹽泉，以硫酸根離子為主時則為硫酸鹽泉。溫泉中所含的陰離子不止一種時，若兩種主要陰離子等量存在，則為混合型的溫泉，硫酸根離子和氯離子同時約等量存在，稱為硫酸鹽氯化物泉；氯離子和碳酸氫根離子同時約等量存在則稱為氯化物碳酸氫鹽泉。通常會依溫泉水酸鹼度，在各分類名稱前加上酸性、中性等形容詞。若是鹼性溫泉，通常都含有大量碳酸氫鈉，所以目前多以「碳酸氫鈉」代替「鹼性」冠在溫泉分類名稱前，如碳酸氫鈉氯化物泉，其ＰH值大約是八至九。
台灣溫泉水質按化學性質分類，主要可分為碳酸氫鹽泉或碳酸鹽泉，主要分布於變質岩區，如中央山脈地區；硫酸鹽泉主要分布於火成岩區，如大屯山地區；氯化物泉主要分布於沉積岩區或海底溫泉區，像綠島朝日溫泉。
台灣各地溫泉的泉質，以碳酸泉數量最多，可說是除了北部大屯山區都是硫磺泉（酸性硫酸鹽泉）外，全省各地都有，張榮南指出，北部陽明山周邊擁有非常多泉質，金山、萬里有無色、無臭，有美人湯之稱的碳酸氫鈉泉、泉質為紅褐色的鐵磺泉跟海底溫泉；北投有牛奶泉、鐵磺泉、碳酸氫鈉泉還有硫磺泉。比較有名的馬槽溫泉、地熱谷就是屬於硫磺泉。西半部從桃園大板根、新竹尖石、苗栗一路到台中大坑都是碳酸泉，知名度較高的新北市烏來、苗栗縣泰安都是碳酸氫鈉泉。而台南關子嶺則擁有俗稱泥漿溫泉、食鹽泉的氫化物泉，除了能泡外，還可以用敷的方式去角質。往南到屏東四重溪則有碳酸氫鈉泉，花蓮縣安通則有酸性硫酸鹽氯化物泉，宜蘭蘇澳有台灣唯一氣泡式碳酸氫鈉冷泉。