這種規模的地震當然也會引想到捷運行駛，今天(20號)上午9點42分地震當時，不少乘客受到驚嚇，而台北捷運透過廣播安撫乘客，並且全線減速行駛，有的列車為求安全，甚至還一度停駛。而目前已經陸續恢復正常行駛。
捷運列車緩緩進站，一個個乘客走下車，因為這起規模6.3的大地震，導致這些台北捷運列車全線減速行駛，就怕這一次的強震導致捷運軌道變形，甚至斷裂，改以時速25公里前進，甚至有的乘客表示，列車有一度停駛的情況就是為了確保安全無虞。
沒發現有地震的乘客只覺得頭暈暈的，還誤以為只是捷運車廂搖晃，但比較敏感的乘客立刻就驚覺有地震，為了安撫驚慌的乘客，捷運不但馬上啟動應變機制，也即時透過廣播安撫恐慌不安的心情，也讓這些被關在車廂裡的乘客，能夠了解最新的情況。
從20號上午9點42分地震發生當下開始，經過將近半小時的減速慢行以後，台北捷運全線，在上午10點04分恢復正常行駛。而台北捷運方面表示，雖然這起地震讓乘客相當有感，但還好沒有導致任何乘客傷亡，捷運系統也沒有受到損害，雖然減速行駛，多多少少會耽誤到乘客的行程，但是為了安全起見，大多數人都表示能夠體諒捷運方面的措施。